"...Для меня непонятно, почему цифры по подъему ( в высоте) в навигаторе и на треках в GPSies разные, причем значительно..."

Думаю, это можно объяснить так -

Показания нафигатора по высоте сильно зависят от числа видимых спутников. В горах (особенно в узких ущельях) условия видимости не всегда идеальны, мягко говоря.
И потому скачки показаний за счет разного кол-ва видимых спутников прибор-дурак считает перепадами высоты и плюсует эти перепады к общему набору.

В результате имеем превышение в полтора раза.

Ознакомился с описанием первой части Вашего похода (8 дней), когда можно будет ознакомиться с описанием второй части?